UE LV348 : BioInformatique Home

Descriptif de l'UE : 3 Ects
Nombre d'heures totales : 30
Nombre d'heures de cours : 9
Nombre d'heures de TD/TP : 21
Année : L3
Semestre : S2

Conditions particulières d'admission à cette UE : aucune
Barème des examens : écrit / 75 - contrôle continu / 25


Il est fortement conseillé d'avoir un bon niveau de programmation pour suivre cette ue (typiquement, d'avoir suivi LV231 et LV229).
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Contenu pédagogique de l'UE :

Objectif : UE à caractère général permettant d'illustrer l'approche informatique en biologie.
Présentation: Analyse de Séquences - Application à la génomique
Plutôt qu'un catalogue exhaustif et superficiel de méthodes, l'enseignement se concentrera sur l'apport de la bioinformatique à la biologie par l'étude de quelques méthodes fondamentales de la bioinformatique.
Méthode de programmation dynamique pour l'alignement avec gap - variantes de l'algorithme (global, local). Systèmes de score des alignements : matrices de substitution. Reconnaissance de motifs.
Les algorithmes correspondant seront programmés en TD/TP et appliqués sur plusieurs génomes bactériens, et des comparaisons seront effectuées entre ceux-ci et un génome eucaryote (levure).