Module d'école doctorale OBI-3

Bases Algorithmiques et Statistiques de l'Analyse des Séquences - Applications avec les logiciels disponibles sur le WEB.


Objectifs:

Montrer les méthodes et algorithmes utilisés en Génomique et analyse de séquence. Ces algorithmes seront étudiés de manière à mettre en évidence la pertinence du paramétrage des logiciels utilisés. Les stagiaires seront capables de mettre en oeuvre de manière adéquate les méthodes bioinformatiques disponibles sur le WEB.
On verra aussi comment installer un logiciel et l'utiliser en mode terminal BLAST par exemple (donc un peu de pratique d'UNIX), notamment pour constater qu'utiliser un logiciel sous UNIX permet toujours d'utiliser plus d'options que sur le WEB, et de personnaliser son travail (on verra comment se constituer une banque d'interêt par exemple.

Contenu:


Planning et contenu un peu plus détaillé

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